הלוגו החדש של משרד החדשנות, המדע והטכנולוגיה מבטא חזון של מדינה מובילה בתחומי המדע, המחקר והטכנולוגיה – עם עוגן בזהות הישראלית. מגן הדוד, הסמל המרכזי בלוגו, עוצב בקווים גיאומטריים מודרניים המדגישים דיוק, תכנון ואסתטיקה טכנולוגית. בצידו העליון-שמאלי של הלוגו מופיעים פיקסלים צבעוניים, שכל אחד מהם מייצג תחום מדעי שונה – החל ממדעי החיים, דרך טכנולוגיות מתקדמות ועד חדשנות. הפיקסלים יחדיו יוצרים תנועה של התחברות והתכנסות אל תוך המערכת הלאומית, וממחישים כיצד ענפי מדע מגוונים פועלים יחד כדי לחזק את מעמדה של ישראל כמעצמה מדעית, חדשנית ומשפיעה בזירה הבינלאומית. 

הלוגו משלב מסורת עם חדשנות – סמל לאומי עם שפה ויזואלית דיגיטלית – ומעביר מסר של קדמה, יצירתיות ועתיד משותף.